¿Puede haber otra interrupción que no sea de linea o VBLANK?

Sí, tienes que leer el registro de estado para que el VDP entienda que has atendido a su interrupción. Si no lo haces, lo que ocurrirá es que tras terminar la rutina de servicio de interrupción ISR, el VDP asume que no le has atendido y volverá a interrumpir a la CPU, y así hasta que leas su registro de estado.

Respecto a si hay otras interrupciones, la respuesta es sí dependiendo de la configuración de tu MSX. Por ejemplo, la disquetera puede emitir interrupciones, pero antes habrías tenido que darle una orden de lectura/escritura, y tras leer un sector, la disquetera envía una interrupción a la CPU para que le atienda y lea/escriba los datos del sector en/desde un buffer. También, recuerda que puedes tener otros VDPs en el sistema. Por ejemplo, si tienes una GFX9000, el V9990 también puede emitir interrupciones, aunque por defecto están desactivadas. Las señales de sincronismo vertical de los VDP adicionales son independientes aunque vayan a la misma frecuencia de barrido.

Hay muchos otros periféricos, y dependiendo del fabricante podrían enviar también sus interrupciones.

Lo que no está muy logrado, en general, en las arquitecturas de Z80 es el filtrado del periférico que provoca la interrupción. El Z80 tiene 3 modos de interrupción, el 0, el 1 que es en el que está habitualmente el MSX y el 2. En el modo 1, la ISR tiene que hacer polling y averiguar qué periférico a emitido la interrupción y leer su registro de estado.

En los modos 0 el periférico puede poner un código de instrucción en el bus de 3 bytes (normalmente una instrucción de salto a una rutina de interrupción), y en el modo 2 el periférico coloca un byte en el bus, y el Z80 puede con ese byte y el valor del registro I crear una dirección de salto a una rutina de interrupción específica, lo que permitiría atender al periférico sin hacer polling. Hasta donde yo sé, ningún fabricante de periféricos dio soporte en el MSX a los modos 0 y 2 del Z80, ni emitiendo instrucciones de salto ni enviando un byte durante la interrupción.

Muy buena y resumidita la explicanción de las interrupciones.
Que yo sepa, el Z80 en el MSX sólo tiene conectada la patilla de interrupción al VDP y a los conectores de cartucho externos.
Creo que nada más puede interrumpir directamente al Z80.
No estoy seguro que la controladora de disco esté conectada ahí.
Los VDPs externos, como V9990 o el de Sega, supongo sí están conectados.

Correcto.
El BIOS sólo atiende la interrupción del VDP en la dirección 38h. No hay rutina para tratar interrupciones de otros periféricos.
Lo que sí hay son 2 ganchos que se podrían desviar a tus propias rutinas y tratar la interrupción de otro hardware que tambien active la INT.